Özellikle migreni tetikleyen tüm noktalara yapılan toksin uygulaması ile başarılı sonuç almak çok olasıdır. Bu nedenle de botoks migren tedavi protokolünde yerini bulmuştur.

Öncelikle uzman hekim tarafından migren tanısı kesinlikle konulmuş olmalıdır. Botulinum toksini sinir-kas iletimini etkileyerek kasların yavaş çalışmasını sağlayarak etki gösterir ve bu mekanizma ile migren ağrılarını durdurur.